液滴數(shù)字PCR芯片結(jié)果自動(dòng)化讀出平臺(tái)的研究
本文關(guān)鍵詞: ddPCR 核酸分子定量 自動(dòng)掃描 液滴識(shí)別 出處:《現(xiàn)代電子技術(shù)》2017年18期 論文類型:期刊論文
【摘要】:液滴數(shù)字聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(ddPCR)作為第三代PCR技術(shù),可實(shí)現(xiàn)核酸分子絕對(duì)定量。然而,在數(shù)字PCR結(jié)果讀出過(guò)程中,對(duì)1 000萬(wàn)量級(jí)的液滴進(jìn)行統(tǒng)計(jì)費(fèi)時(shí)費(fèi)力而且容易出錯(cuò)。針對(duì)此情況設(shè)計(jì)了液滴數(shù)字PCR芯片的自動(dòng)掃描識(shí)別平臺(tái),系統(tǒng)包括硬件移動(dòng)平臺(tái)和軟件拍照、拼接和識(shí)別功能。軟件控制平移臺(tái)順序移動(dòng)并控制攝像頭拍照,移動(dòng)完成后把拍得的照片拼接成一張圖片,之后對(duì)圖片中的液滴進(jìn)行識(shí)別。此平臺(tái)通過(guò)二維平移臺(tái)的精確定位掃描及圖像分割、識(shí)別算法,對(duì)熒光和非熒光液滴識(shí)別率達(dá)到99.6%以上。平臺(tái)已經(jīng)應(yīng)用到了實(shí)驗(yàn)室中,對(duì)數(shù)字PCR芯片上的微液滴可實(shí)現(xiàn)一鍵識(shí)別,極大的減小了識(shí)別時(shí)間和錯(cuò)誤率。
[Abstract]:As the third generation PCR technique, droplet digital polymerase chain reaction (DDP) can realize absolute quantification of nucleic acid molecules. However, in the process of reading out the results of digital PCR, It is time-consuming and error-prone to count 10 million droplets. An automatic scanning and identification platform for droplet digital PCR chip is designed in this paper. The system includes hardware mobile platform and software photography. The software controls the translation table to move sequentially and control the camera to take pictures. After the movement is completed, the photos are spliced into a picture. The platform has been applied to the laboratory, and the recognition rate of the fluorescent and non-fluorescent droplets is more than 99.6% through the precise location, scanning and image segmentation of the two-dimensional translation platform, and the recognition rate of the fluorescent and non-fluorescent droplets is more than 99.6%, and the platform has been applied to the laboratory. The microdroplets on the digital PCR chip can be recognized by one key, which greatly reduces the recognition time and error rate.
【作者單位】: 上海大學(xué)量子與分子結(jié)構(gòu)國(guó)際中心;中國(guó)科學(xué)院上海微系統(tǒng)與信息技術(shù)研究所;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(21275153;61302052;61571428) 上海市浦江人才項(xiàng)目(15PJ1409800)
【分類號(hào)】:Q503;TN492
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前1條
1 馬劍峰;王麗;馬絮飛;吳燕;白志學(xué);劉杰;楊貴忠;高建新;;液滴紅外光電自動(dòng)檢測(cè)計(jì)數(shù)器的研制[J];實(shí)驗(yàn)室研究與探索;2008年06期
相關(guān)會(huì)議論文 前1條
1 張強(qiáng);張沛然;王婷婷;楊孟龍;馬波;;基于電磁閥吸吮液滴分選的單細(xì)胞分離、獲取及分析[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第29屆學(xué)術(shù)年會(huì)摘要集——第02分會(huì):分離分析及微、納流控新方法[C];2014年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前3條
1 劉雯雯;基于微流控液滴技術(shù)的基因定量分析和蛋白質(zhì)配體篩選系統(tǒng)的研究[D];浙江大學(xué);2017年
2 古淑青;微流控液滴單細(xì)胞分析系統(tǒng)的研究[D];浙江大學(xué);2011年
3 張?jiān)葡?基于納升級(jí)液滴陣列的實(shí)時(shí)定量RT-PCR系統(tǒng)的研究及其在單細(xì)胞中MicroRNA定量檢測(cè)中的應(yīng)用[D];浙江大學(xué);2013年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前5條
1 潘如意;微流控液滴多級(jí)分裂系統(tǒng)用于單細(xì)胞封裝的研究[D];東北大學(xué);2013年
2 龔瑩瑩;液滴微流控芯片用于酶活力的測(cè)定和細(xì)胞包裹[D];華中科技大學(xué);2009年
3 劉傳森;基于微流控芯片的微井及液滴陣列細(xì)胞捕獲方法研究[D];清華大學(xué);2011年
4 吳靚;液滴包裹與分選微流控芯片研究[D];華中科技大學(xué);2012年
5 沙俊;基于毛細(xì)管與微流控芯片的液滴發(fā)生及大腸桿菌轉(zhuǎn)化[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2011年
,本文編號(hào):1552241
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/dianzigongchenglunwen/1552241.html