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液滴數(shù)字PCR芯片結(jié)果自動(dòng)化讀出平臺(tái)的研究

發(fā)布時(shí)間:2018-03-01 14:07

  本文關(guān)鍵詞: ddPCR 核酸分子定量 自動(dòng)掃描 液滴識(shí)別 出處:《現(xiàn)代電子技術(shù)》2017年18期  論文類型:期刊論文


【摘要】:液滴數(shù)字聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(ddPCR)作為第三代PCR技術(shù),可實(shí)現(xiàn)核酸分子絕對(duì)定量。然而,在數(shù)字PCR結(jié)果讀出過(guò)程中,對(duì)1 000萬(wàn)量級(jí)的液滴進(jìn)行統(tǒng)計(jì)費(fèi)時(shí)費(fèi)力而且容易出錯(cuò)。針對(duì)此情況設(shè)計(jì)了液滴數(shù)字PCR芯片的自動(dòng)掃描識(shí)別平臺(tái),系統(tǒng)包括硬件移動(dòng)平臺(tái)和軟件拍照、拼接和識(shí)別功能。軟件控制平移臺(tái)順序移動(dòng)并控制攝像頭拍照,移動(dòng)完成后把拍得的照片拼接成一張圖片,之后對(duì)圖片中的液滴進(jìn)行識(shí)別。此平臺(tái)通過(guò)二維平移臺(tái)的精確定位掃描及圖像分割、識(shí)別算法,對(duì)熒光和非熒光液滴識(shí)別率達(dá)到99.6%以上。平臺(tái)已經(jīng)應(yīng)用到了實(shí)驗(yàn)室中,對(duì)數(shù)字PCR芯片上的微液滴可實(shí)現(xiàn)一鍵識(shí)別,極大的減小了識(shí)別時(shí)間和錯(cuò)誤率。
[Abstract]:As the third generation PCR technique, droplet digital polymerase chain reaction (DDP) can realize absolute quantification of nucleic acid molecules. However, in the process of reading out the results of digital PCR, It is time-consuming and error-prone to count 10 million droplets. An automatic scanning and identification platform for droplet digital PCR chip is designed in this paper. The system includes hardware mobile platform and software photography. The software controls the translation table to move sequentially and control the camera to take pictures. After the movement is completed, the photos are spliced into a picture. The platform has been applied to the laboratory, and the recognition rate of the fluorescent and non-fluorescent droplets is more than 99.6% through the precise location, scanning and image segmentation of the two-dimensional translation platform, and the recognition rate of the fluorescent and non-fluorescent droplets is more than 99.6%, and the platform has been applied to the laboratory. The microdroplets on the digital PCR chip can be recognized by one key, which greatly reduces the recognition time and error rate.
【作者單位】: 上海大學(xué)量子與分子結(jié)構(gòu)國(guó)際中心;中國(guó)科學(xué)院上海微系統(tǒng)與信息技術(shù)研究所;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(21275153;61302052;61571428) 上海市浦江人才項(xiàng)目(15PJ1409800)
【分類號(hào)】:Q503;TN492

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本文編號(hào):1552241

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