基于新型納米材料與核酸酶的傳感器在生物分析中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-12-11 17:39
背景蛋白質(zhì)和核酸檢測對于病原感染、遺傳疾病、法醫(yī)分析和現(xiàn)代生命科學(xué)的發(fā)展至關(guān)重要。但是,生物分析往往目標(biāo)物含量少、雜質(zhì)多,因而開發(fā)新型的高靈敏檢測手段十分必要。納米材料具有獨(dú)特的光學(xué)性質(zhì)和良好的生物相容性因而廣泛應(yīng)用于生物分析中。核酸酶是能夠?qū)⒑怂徭湹牧姿岫ユI切斷的酶,常作為一種重要的工具用于生物分析中。本研究通過新型的納米材料核酸酶的DNA末端保護(hù)技術(shù)和信號放大技術(shù)構(gòu)建了背景低、特異性好、靈敏度高的核酸與蛋白質(zhì)檢測的新方法。目的(1)構(gòu)建基于陽離子共軛聚合物和外切酶Ⅰ的熒光檢測方法用于蛋白質(zhì)檢測及細(xì)胞成像,實(shí)現(xiàn)鏈霉親和素和葉酸受體的檢測以及HeLa熒光成像;(2)構(gòu)建基于核酸外切酶Ⅲ及MoS2納米片熒光猝滅性能的DNA雙重信號放大檢測方法,實(shí)現(xiàn)人血色素沉著癥基因的檢測。方法(1)鏈霉親和素(Strepavidin,SA)和生物素可以通過特異性結(jié)合,從而阻止探針核酸P1被核酸外切酶Ⅰ(Exonuclease Ⅰ,Exo Ⅰ)的消化,帶正電荷的陽離子熒光共軛聚合物(Polymer poly(9,9-bis(6’-N,N,Ntrimethylammonium)hex...
【文章來源】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院河南省
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
制備的PFP的FTIR光譜(A)和Zeta電位(B)
新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文9以具有較高熒光量子產(chǎn)率的PFP(Ex:370nm,Em:425nm)為能量供體。選擇最大吸收在490nm處,發(fā)射在530nm處的FAM標(biāo)記P1為受體,因?yàn)槠湮张cPFP的特征發(fā)射重疊(425nm,圖1.3)。在沒有SA的情況下,P1被ExoI從3’端依次消化水解成單核苷酸。而由于單核苷酸與PFP之間的靜電相互作用相對較弱,導(dǎo)致FAM遠(yuǎn)離PFP,F(xiàn)RET很難發(fā)生。當(dāng)SA存在時(shí),SA和生物素的高度結(jié)合阻止了P1被ExoI消化,這是由于蛋白質(zhì)-配體特異性相互作用產(chǎn)生了顯著的空間位阻。隨后,帶正電荷的PFP通過靜電相互作用靠近P1,使得從PFP到FAM發(fā)生FRET,在530nm處檢測到增強(qiáng)的熒光發(fā)射。因此,通過檢測FAM和PFP的FRET比值(I530/I425)來實(shí)現(xiàn)目標(biāo)檢測。FRET比值與SA的濃度成正比。圖1.1制備的PFP的FTIR光譜(A)和Zeta電位(B)。Fig.1.1FTIRspectrum(A)andzetapotential(B)oftheas-preparedPFP.圖1.2基于陽離子共軛聚合物和外切酶I的蛋白質(zhì)檢測原理圖。Fig.1.2SchematicdiagramofproteindetectionbasedoncationicconjugatedpolymerandExoI.
新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文10圖1.3PFP(abs,a;em,b)和P1(abs,c;em,d)的吸光度和熒光光譜。Fig.1.3AbsorbanceandfluorescencespectraofPFP(Abs,a;Em,b)andP1(Abs,c;Em,d).1.3.2方法的可行性分析首先通過凝膠電泳驗(yàn)證SA對P1的末端保護(hù)。如圖1.4A所示,只有P1時(shí)有一個(gè)非常明顯的條帶(泳道1),在加入ExoI后(泳道2)條帶消失。這表明ExoI能夠有效地消化水解P1。在沒有ExoI的情況下,將P1與SA混合,觀察到兩個(gè)條帶發(fā)生不同的條帶遷移(泳道3),這歸因于P1和SA的結(jié)合。當(dāng)P1與SA結(jié)合后加入ExoI時(shí),仍然檢測到條帶遷移(泳道4)。這證明SA-P1復(fù)合物能保護(hù)P1使其免受ExoI消化。測量了不同條件下FRET的熒光強(qiáng)度,驗(yàn)證了該方法的可行性。相應(yīng)的熒光光譜如圖1.4B所示。在發(fā)射波長530nm、激發(fā)波長370nm處,P1表現(xiàn)出很弱的熒光強(qiáng)度(曲線a)。在P1溶液中加入PFP,在425nm處和530nm處可以明顯觀察到PFP和FAM的熒光信號(曲線b)。結(jié)果證實(shí),P1通過強(qiáng)靜電力與PFP結(jié)合,并導(dǎo)致從PFP到FAM發(fā)生有效的FRET。然而,在加入PFP之前隨著ExoI和P1的混合,在沒有SA的情況下,530nm處的熒光強(qiáng)度顯著降低(曲線c)。這一現(xiàn)象表明ExoI催化消化P1產(chǎn)生單核苷酸,導(dǎo)致PFP和FAM之間的FRET效率低下。而P1與SA混合,然后加入ExoI和PFP,結(jié)果PFP在425nm處的熒光強(qiáng)度降低,530nm處熒光強(qiáng)度明顯增強(qiáng)(曲線d)。表明生物素與SA的特異性結(jié)合抑制ExoI消化P1并產(chǎn)生有效的FRET。上述結(jié)果表明,該方法可用于蛋白質(zhì)分析。
本文編號:3535103
【文章來源】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院河南省
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
制備的PFP的FTIR光譜(A)和Zeta電位(B)
新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文9以具有較高熒光量子產(chǎn)率的PFP(Ex:370nm,Em:425nm)為能量供體。選擇最大吸收在490nm處,發(fā)射在530nm處的FAM標(biāo)記P1為受體,因?yàn)槠湮张cPFP的特征發(fā)射重疊(425nm,圖1.3)。在沒有SA的情況下,P1被ExoI從3’端依次消化水解成單核苷酸。而由于單核苷酸與PFP之間的靜電相互作用相對較弱,導(dǎo)致FAM遠(yuǎn)離PFP,F(xiàn)RET很難發(fā)生。當(dāng)SA存在時(shí),SA和生物素的高度結(jié)合阻止了P1被ExoI消化,這是由于蛋白質(zhì)-配體特異性相互作用產(chǎn)生了顯著的空間位阻。隨后,帶正電荷的PFP通過靜電相互作用靠近P1,使得從PFP到FAM發(fā)生FRET,在530nm處檢測到增強(qiáng)的熒光發(fā)射。因此,通過檢測FAM和PFP的FRET比值(I530/I425)來實(shí)現(xiàn)目標(biāo)檢測。FRET比值與SA的濃度成正比。圖1.1制備的PFP的FTIR光譜(A)和Zeta電位(B)。Fig.1.1FTIRspectrum(A)andzetapotential(B)oftheas-preparedPFP.圖1.2基于陽離子共軛聚合物和外切酶I的蛋白質(zhì)檢測原理圖。Fig.1.2SchematicdiagramofproteindetectionbasedoncationicconjugatedpolymerandExoI.
新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文10圖1.3PFP(abs,a;em,b)和P1(abs,c;em,d)的吸光度和熒光光譜。Fig.1.3AbsorbanceandfluorescencespectraofPFP(Abs,a;Em,b)andP1(Abs,c;Em,d).1.3.2方法的可行性分析首先通過凝膠電泳驗(yàn)證SA對P1的末端保護(hù)。如圖1.4A所示,只有P1時(shí)有一個(gè)非常明顯的條帶(泳道1),在加入ExoI后(泳道2)條帶消失。這表明ExoI能夠有效地消化水解P1。在沒有ExoI的情況下,將P1與SA混合,觀察到兩個(gè)條帶發(fā)生不同的條帶遷移(泳道3),這歸因于P1和SA的結(jié)合。當(dāng)P1與SA結(jié)合后加入ExoI時(shí),仍然檢測到條帶遷移(泳道4)。這證明SA-P1復(fù)合物能保護(hù)P1使其免受ExoI消化。測量了不同條件下FRET的熒光強(qiáng)度,驗(yàn)證了該方法的可行性。相應(yīng)的熒光光譜如圖1.4B所示。在發(fā)射波長530nm、激發(fā)波長370nm處,P1表現(xiàn)出很弱的熒光強(qiáng)度(曲線a)。在P1溶液中加入PFP,在425nm處和530nm處可以明顯觀察到PFP和FAM的熒光信號(曲線b)。結(jié)果證實(shí),P1通過強(qiáng)靜電力與PFP結(jié)合,并導(dǎo)致從PFP到FAM發(fā)生有效的FRET。然而,在加入PFP之前隨著ExoI和P1的混合,在沒有SA的情況下,530nm處的熒光強(qiáng)度顯著降低(曲線c)。這一現(xiàn)象表明ExoI催化消化P1產(chǎn)生單核苷酸,導(dǎo)致PFP和FAM之間的FRET效率低下。而P1與SA混合,然后加入ExoI和PFP,結(jié)果PFP在425nm處的熒光強(qiáng)度降低,530nm處熒光強(qiáng)度明顯增強(qiáng)(曲線d)。表明生物素與SA的特異性結(jié)合抑制ExoI消化P1并產(chǎn)生有效的FRET。上述結(jié)果表明,該方法可用于蛋白質(zhì)分析。
本文編號:3535103
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