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二硫化鉬納米孔DNA測序若干影響因素的模擬研究

發(fā)布時間:2021-09-03 18:46
  近年來,基因測序在疾病預(yù)測和治療上顯示出巨大的應(yīng)用價值,發(fā)展高效的基因測序技術(shù)具有重要意義。目前,固態(tài)納米孔測序被認為是最具潛力的新一代測序方法,其中,二維單層二硫化鉬納米材料因具有優(yōu)異的電子性能和機械性能、易制備、以及價格低廉等特點而備受關(guān)注,被認為是非常有前途的可用于基因測序的納米材料。針對固態(tài)納米孔DNA測序低分辨率的問題,本論文利用分子動力學(xué)模擬的方法,探索了DNA在二硫化鉬表面的吸附行為,并基于DNA在二硫化鉬表面的吸附取向,進一步探索了在電壓和牽引力兩種作用模式下,電壓、納米孔直徑、牽引力和電荷等因素對利用二硫化鉬納米孔DNA測序的影響,并通過分子模擬獲得了最佳二硫化鉬納米孔測序模型,對實驗提供了有益的指導(dǎo)。本論文具體結(jié)論如下:1、從分子水平探討了不同初始取向的DNA在二硫化鉬表面的吸附行為,研究結(jié)果表明,初始構(gòu)型為水平和垂直的DNA體系均傾向于垂直吸附在二硫化鉬表面,且DNA在二硫化鉬表面的吸附取向不受DNA雙鏈的順序和長度影響。其原因是DNA兩側(cè)的磷酸根與二硫化鉬中的硫原子存在較強的靜電斥力,導(dǎo)致DNA無法水平吸附在二硫化鉬表面,且DNA在范德華力的作用下傾向于通過端部... 

【文章來源】:杭州電子科技大學(xué)浙江省

【文章頁數(shù)】:58 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

二硫化鉬納米孔DNA測序若干影響因素的模擬研究


納米孔測序的阻塞離子電流信號圖

氣泡圖,納米,溶血素,桿菌


杭州電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文2圖1.1納米孔測序的阻塞離子電流信號圖1.2第三代DNA分子測序技術(shù)1.2.1生物納米孔DNA測序技術(shù)發(fā)展生物納米孔測序主要是利用自身的磷脂雙分子層,通過蛋白質(zhì)嵌入形成一種天然通道。生物納米孔的類型分為α-溶血素[9]、氣泡單胞菌溶素[10]、恥垢分枝桿菌[11]、以及噬菌體phi29連接器[12],如圖1.2所示[13]。當(dāng)電壓通過磷脂雙分子膜時,通過生物納米孔隙產(chǎn)生離子電流。每當(dāng)有DNA分子通過孔洞時,孔洞的離子電流發(fā)生改變,不同類型的核苷酸分子對孔洞的阻礙情況不同,從而產(chǎn)生不同的離子電流信號。常用的生物納米孔主要分為α-溶血素[14]和恥垢分枝桿菌(MspA)[15]兩種類型孔蛋白。圖1.2四種生物納米孔示意圖(A)α-溶血素生物納米孔(B)氣泡單胞菌溶素生物納米孔(C)恥垢分枝桿菌生物納米孔(D)以及噬菌體phi29連接器生物納米孔

二硫化鉬納米孔DNA測序若干影響因素的模擬研究


理論、模擬和實驗三者之間的關(guān)系

【參考文獻】:
期刊論文
[1]牛頓第二定律在動力學(xué)問題中的應(yīng)用[J]. 古煥標(biāo).  廣東教育(高中版). 2017(12)
[2]生物納米孔分析技術(shù)研究進展[J]. 尚積禎,李志,郗冬梅,張書圣.  應(yīng)用化學(xué). 2017(08)
[3]分子動力學(xué)模擬及應(yīng)用簡介[J]. 關(guān)榮華,周慧.  黑龍江科技信息. 2016(33)
[4]應(yīng)用L-J(12/6)勢能模型對Fe2+水化作用的分子動力學(xué)模擬(英文)[J]. 宋玉財,張志剛,胡文瑄,段振豪.  無機化學(xué)學(xué)報. 2007(04)
[5]基于氫鍵和π-π堆積作用組裝的新型超分子配合物[Cu2(Hhbd)2(mphen)2]·2H2O[J]. 付峰,余紅斌,董金亮,錢延安,王寶軍,李東升.  延安大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2006(02)

博士論文
[1]DNA和二維納米材料的界面作用行為及其在熒光生物傳感中的應(yīng)用[D]. 陸暢.浙江大學(xué) 2017
[2]納米孔檢測系統(tǒng)的研制及其在單分子檢測中的應(yīng)用[D]. 吳宏文.東南大學(xué) 2016

碩士論文
[1]幾種納米材料相變的尺寸效應(yīng)[D]. 姜如.湘潭大學(xué) 2013



本文編號:3381658

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