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電場下多肽在納米管中輸運(yùn)的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究

發(fā)布時(shí)間:2021-09-03 17:36
  碳納米管的分子動(dòng)力學(xué)研究是目前研究的熱點(diǎn),尤其是在碳納米管作為運(yùn)輸通道的作用,對(duì)此輸運(yùn)作用在微觀尺度下的分子動(dòng)力學(xué)研究,對(duì)碳納米管作在醫(yī)療領(lǐng)域下的藥物輸運(yùn)的應(yīng)用具有很重要的研究意義。本文運(yùn)用分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法,模擬了多肽(R8)在外部電場的作用下,通過碳納米管過程中的結(jié)構(gòu)以及動(dòng)力學(xué)行為。我們分別考察了多種因素對(duì)這一輸運(yùn)過程的影響,其中有:通過調(diào)節(jié)碳納米管的有無,來觀察碳納米管的存在是否有利于多肽的運(yùn)輸;通過是否加入外加電場,來觀察外部電場的存在是否有利于多肽的運(yùn)輸;通過調(diào)節(jié)外加電場的強(qiáng)度,考察不同強(qiáng)度的場強(qiáng)對(duì)多肽通過碳納米管運(yùn)動(dòng)的影響;通過改變碳納米管的種類,考察并對(duì)比單壁與雙壁碳納米管輸運(yùn)多肽的過程。通過分析模擬結(jié)果中的Lennard-Jones勢(shì)能、PMF自由能以及RMSD均方根方差等物理量,來詳細(xì)地分析整個(gè)運(yùn)動(dòng)過程,并定性地描述這些因素對(duì)此輸運(yùn)作用的影響。模擬結(jié)果表明,碳納米管在一定條件下的確能夠加速多肽的運(yùn)動(dòng);多肽在未加外部電場的情況下,不能自發(fā)進(jìn)入碳納米管;外部電場能夠顯著地提高多肽通過碳納米管的效率,而且隨著電場強(qiáng)度的增加,輸運(yùn)效率提高;單壁碳納米管相比雙壁碳納米管,更適... 

【文章來源】:廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:65 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

電場下多肽在納米管中輸運(yùn)的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究


圖2-1?Graphene,?SWCNT和DWCNT的示意圖【2】??碳納米管可以被看成一種在納米層級(jí)的無縫中空管狀物體,它是通過石墨烯??

手性,單壁碳納米管


多個(gè)不同直徑的SWCNT通過同軸套裝組成,其層數(shù)有2?50不等,層間距與石??墨烯層間距相當(dāng),約為〇.34±0.01nm。其中,Graphene,SWCNT和MWCNT的結(jié)??構(gòu)如圖2-1所示。??IW1II??圖2-2單壁碳納米管的手性圖[3]??前面已經(jīng)提到,SWCNT可以看成是由單層石墨烯片以某一卷曲角卷曲而形??成,所形成的碳納米管的結(jié)構(gòu)會(huì)根據(jù)卷曲角的變化而有所差別。那么可以根據(jù)碳原??子六角點(diǎn)陣的不同卷曲方式,將碳納米管分類成三種不同的手性:扶手椅??(Armchair)、鋸齒(Zigzag)和螺旋(Chrial)[2Q],如圖2-2所示[21],同時(shí)也可以看出??不同手性碳納米管的卷曲方式。圖中瓦和石分別表示正六邊形晶格的兩個(gè)基??矢,選取此石墨烯片上任兩個(gè)碳原子作為起點(diǎn)和終點(diǎn),那么此兩點(diǎn)間的矢量可表示??為:??Ch?=?rial?+?rrial?(2-1)??其中,n和m分別表示K和石的重復(fù)周期,碳納米管的手性則通過G來表??示。由上式知道,碳納米管的手性是由每一組n和m來確定的,因此碳納米管??的手性可以用(n

人免疫缺陷病毒,轉(zhuǎn)錄激活因子,過程,輸運(yùn)作用


CPPs作為載體的優(yōu)勢(shì)有兩點(diǎn),一個(gè)是它在輸運(yùn)作用中對(duì)細(xì)胞的低毒性,其次??是它的作用是廣譜的,沒有靶向細(xì)胞類型的限制。細(xì)胞穿透肽進(jìn)入細(xì)胞的作用過程??如圖2-3所示。??cargo??二:?r:?::?t:?r:??彐?nucleus?::::?云泛?辦??么?cytoplasm?夕?為?々,,^??*?*?^??D?E?『??^“““々/,,夕?‘么??^?^?q、淶、f?:?A?7?^??r.,,?衫、,??V%??,,夕?<,,??rf-v:;i:u^? ̄?::nuw?'?k??圖2-3?CPP進(jìn)入細(xì)胞的過程⑴??1型人免疫缺陷病毒轉(zhuǎn)錄激活因子(trans-activator?of?transcription,?TAT),是一??個(gè)典型的細(xì)胞穿透肽

【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]富含胍基的細(xì)胞穿膜肽合成[D]. 楊冬梅.華中科技大學(xué) 2012



本文編號(hào):3381556

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