基于二維埃及藍(lán)和金屬有機(jī)骨架納米片的磷酸化肽選擇性富集新方法
發(fā)布時(shí)間:2021-01-12 01:04
蛋白質(zhì)磷酸化在調(diào)控生命活動(dòng)中發(fā)揮重要作用。利用蛋白組學(xué)技術(shù)大規(guī)模分析磷酸化蛋白的主要障礙在于復(fù)雜樣品中痕量磷酸化蛋白的高效富集。針對(duì)這個(gè)問題,研究工作者發(fā)展了“自下而上”樣品預(yù)處理和質(zhì)譜(MS)分析方法,將蛋白酶解后的磷酸化肽段進(jìn)行富集,利用質(zhì)譜實(shí)現(xiàn)磷酸化蛋白的檢測(cè)。此方法的關(guān)鍵在于磷酸化肽段的高選擇性富集。目前,已有許多材料和方法策略用于磷酸化肽段的高效富集。但在選擇性富集特定磷酸化肽方面進(jìn)展不多。本論文將二維片層材料應(yīng)用于富集磷酸化肽,開展了基于埃及藍(lán)和金屬有機(jī)骨架納米片的研究工作。具體的研究?jī)?nèi)容和取得的研究進(jìn)展如下:1、基于剝離的二維埃及藍(lán)納米片對(duì)多磷酸化肽的特異性富集方法研究從復(fù)雜生物樣品中富集低豐度的磷酸化肽對(duì)于研究磷酸化蛋白具有重要的意義。但是選擇性地富集多磷酸化肽卻有很少報(bào)道。在本體系中,我們合成了三種二維納米片,包括CaCuSi4O10納米片,SrCuSi4O10納米片和BaCuSi4O10納米片,它們是首次應(yīng)用于富集磷酸化肽。二維CaCuSi4OH)納米片有富集多磷酸化肽的特異性效果,并且在酸度以及有機(jī)溶劑比例改變的條件下,這種特異性富集效果不會(huì)改變。二維CaCuSi...
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1蛋白質(zhì)組學(xué)概述示意圖??
關(guān)鍵的調(diào)控作用在功能化蛋白質(zhì)的形成過程中的規(guī)律性無法在基因水平上得到??答案。因此,蛋白質(zhì)翻譯后修飾現(xiàn)己成為蛋白質(zhì)組研宄中的重要內(nèi)容之一。截至??目前,已經(jīng)有報(bào)道過的翻譯后修飾方式有150多種(如圖1.2),常見的類型有磷??酸化、甲基化、乙酰化、糖基化、泛素化和亞硝基化修飾等。其中研宄較多的有??磷酸化方式和糖基化方式8。??祕(mì)??Ribosome??£?.?Hydroxylation?i?Phosphorylation?容,^??.R?Attech?s?a?hydroxyl?Adds?a?phosphate?to?M,??group?(-OH)?to?a?side?serine,?threonine?or??ts?v?dwin?of?a?protein?tyrosine?°?1?^??\?^?、?/??^?Methylatlon?Giycosylation?篆:??/?Adds?a?methyl?group,?^?Attaches?a?sugar,?usually??usuaBy?at?lysine?or?M?,to?an?V?or?W?In?an??*?arginine?residues?amino?acid?side?chain?'■??{?1??i.?Lipldation?、?人?Ubiqultination?£?.,-4SS>??''^?^?^?
?protein??Pi??圖1.3蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化過程??根據(jù)氨基酸中所含R基的不同,蛋白質(zhì)中的可逆磷酸化過程主要分為4類:??(1)?0位磷酸化,是最為常見的一種磷酸化類型,通過羥基氨基酸形成磷酸化,??如酪氨酸、蘇氨酸或絲氨酸,三者的比例為1:?200:?1800;?(2)N位磷酸化,磷??酸化的形成主要通過精氨酸、組氨酸或賴氨酸;(3)?S位磷酸化,通過半胱氨酸形??成磷酸化;(4)磷酸化的酰基,通過精氨酸、組氨酸或賴氨酸形成磷酸化。磷酸化??氨基酸具有不同的化學(xué)穩(wěn)定性,相比于后三種,第一種比較穩(wěn)定,也是研宄最多??的,目前已形成較為成熟的研究方法。鑒于磷酸化修飾過程在生命活動(dòng)中所展現(xiàn)??出的重要意義
本文編號(hào):2971825
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1蛋白質(zhì)組學(xué)概述示意圖??
關(guān)鍵的調(diào)控作用在功能化蛋白質(zhì)的形成過程中的規(guī)律性無法在基因水平上得到??答案。因此,蛋白質(zhì)翻譯后修飾現(xiàn)己成為蛋白質(zhì)組研宄中的重要內(nèi)容之一。截至??目前,已經(jīng)有報(bào)道過的翻譯后修飾方式有150多種(如圖1.2),常見的類型有磷??酸化、甲基化、乙酰化、糖基化、泛素化和亞硝基化修飾等。其中研宄較多的有??磷酸化方式和糖基化方式8。??祕(mì)??Ribosome??£?.?Hydroxylation?i?Phosphorylation?容,^??.R?Attech?s?a?hydroxyl?Adds?a?phosphate?to?M,??group?(-OH)?to?a?side?serine,?threonine?or??ts?v?dwin?of?a?protein?tyrosine?°?1?^??\?^?、?/??^?Methylatlon?Giycosylation?篆:??/?Adds?a?methyl?group,?^?Attaches?a?sugar,?usually??usuaBy?at?lysine?or?M?,to?an?V?or?W?In?an??*?arginine?residues?amino?acid?side?chain?'■??{?1??i.?Lipldation?、?人?Ubiqultination?£?.,-4SS>??''^?^?^?
?protein??Pi??圖1.3蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化過程??根據(jù)氨基酸中所含R基的不同,蛋白質(zhì)中的可逆磷酸化過程主要分為4類:??(1)?0位磷酸化,是最為常見的一種磷酸化類型,通過羥基氨基酸形成磷酸化,??如酪氨酸、蘇氨酸或絲氨酸,三者的比例為1:?200:?1800;?(2)N位磷酸化,磷??酸化的形成主要通過精氨酸、組氨酸或賴氨酸;(3)?S位磷酸化,通過半胱氨酸形??成磷酸化;(4)磷酸化的酰基,通過精氨酸、組氨酸或賴氨酸形成磷酸化。磷酸化??氨基酸具有不同的化學(xué)穩(wěn)定性,相比于后三種,第一種比較穩(wěn)定,也是研宄最多??的,目前已形成較為成熟的研究方法。鑒于磷酸化修飾過程在生命活動(dòng)中所展現(xiàn)??出的重要意義
本文編號(hào):2971825
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