通過調(diào)控溶液的pH、選擇不同速率熱退火方式,以四點星DNA分子瓦為建筑模塊,根據(jù)沃森-克里克堿基互補(bǔ)配對原則和Hoogsteen氫鍵配對連接,選擇性地組裝成不同的DNA多面體結(jié)構(gòu)。非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳表征結(jié)果表明,在酸性條件（pH 5. 5）及退火時間5. 0 h下,分子瓦自組裝成DNA變形四面體（tTET）結(jié)構(gòu);在中性條件（pH 8. 0）及退火時間24. 0 h下,自組裝形成DNA八面體（OCT）結(jié)構(gòu)。在中性條件（pH 8. 0）下,只改變分子瓦黏性末端堿基的數(shù)目,直至形成不同數(shù)目的堿基對來產(chǎn)生不同強(qiáng)度的作用力,也能類似地組裝成不同的DNA多面體結(jié)構(gòu)。該結(jié)果也由非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳進(jìn)行了表征。 

【文章來源】：現(xiàn)代化工. 2020年04期 第179-183頁 北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

四點星DNA分子瓦示意圖及DNA序列

不同pH(5.5～8.0)下快速退火(2.0 h)、中速退火(5.0 h)和慢速退火(24.0 h)組裝的多面體的PAGE膠圖如圖2(a)～圖2(c)所示。由圖2(a)～圖2(c)可以看出，各個p H組裝的樣品均在p H 5.5緩沖液中跑膠。利用圖象處理軟件—ImageJ分析組裝產(chǎn)物，結(jié)果如圖2(d)所示。從圖2(d)中可以看出，對于各種退火方法，隨著pH的增加，OCT/t TET的比例也在增加�？梢悦黠@觀察到退火對多面體結(jié)構(gòu)生長的影響:快速退火時，多面體結(jié)構(gòu)生長主要受動力學(xué)控制，容易形成最簡單的不穩(wěn)定t TET結(jié)構(gòu);而在慢火退火過程中，多面體結(jié)構(gòu)的生長主要受熱力學(xué)控制，因此往往形成最穩(wěn)定的OCT結(jié)構(gòu);中速退火是介于兩者之間，但分布梯度最明顯。3.2.2最佳條件下2種不同結(jié)構(gòu)的組裝

除了上述pH和退火方法影響多面體結(jié)構(gòu)的組裝，直接增加分子瓦黏性末端堿基的數(shù)量即生成更多沃森-克里克堿基對來探究其對多面體結(jié)構(gòu)的生長影響。正如上面提到的，在不同p H和退火方法下組裝不同的多面體結(jié)構(gòu)，其分子瓦在A/B端各有額外的尾鏈和黏性末端分別有4/4個堿基。而新的3種分子瓦均沒有額外尾鏈，如圖4所示。圖4 3種不同的黏性末端長度的四點星分子瓦示意圖及組裝產(chǎn)物膠圖


本文編號：2910196