目的比較志賀菌耐藥信息與其spacer同源質(zhì)�；蚴删w耐藥信息的關(guān)系。方法應(yīng)用CRISPR Target和BLAST尋找spacer同源質(zhì)粒和噬菌體,根據(jù)登記號(hào)在NCBI或GenBank中尋找目標(biāo)質(zhì)粒或噬菌體上的耐藥信息;應(yīng)用Bioedit軟件尋找GenBank中志賀菌的的耐藥信息。結(jié)果數(shù)據(jù)庫(kù)及臨床分離株志賀菌共52條spacer中有7個(gè)spacer與4個(gè)攜帶耐藥基因的質(zhì)粒同源;間隔序列CRISPR2-mel-3同源質(zhì)粒pUMNF18_IncFV及攜帶該間隔序列的志賀菌mel-ss1998011/zz、mel-ss1998024/zz、mel-sf2005082/sx、mel-sf2013004/bj均含有相同耐藥基因blaTEM、aadA2和dfrA12,間隔序列CRISPR-Q1-S1、CRISPR-Q4-S1同源的質(zhì)粒pM5A24P及該間隔序列所在志賀菌sd1012均攜帶耐藥基因ampC和tetB;間隔序列CRISPR3-mel-33同源質(zhì)粒plasmid:5與該間隔序列所在志賀菌mel-sf2000102/zz均攜帶相同耐藥基因ampH、mrdA,且二者均攜... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2016,11(10)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【文章目錄】：
材料與方法
    1 材料
        1.1 Spacer來(lái)源
        1.2 耐藥基因
        1.3 生物信息學(xué)軟件和網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器
    2 方法
        2.1 志賀菌及同源序列噬菌體和質(zhì)粒相關(guān)信息的獲取
        2.2志賀菌毒力基因擴(kuò)增
            2.1.1 引物設(shè)計(jì)與合成
            2.1.2 PCR擴(kuò)增毒力基因
結(jié)果
    1 spacer同源質(zhì)粒及其所在菌株信息
    2耐藥基因信息
    3 耐藥相關(guān)信息
    4 其他相關(guān)信息
討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]天津地區(qū)福氏志賀菌整合子攜帶及耐藥性研究[J]. 王俊,祁偉,王淑香,郭文學(xué).  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2014(02)

碩士論文
[1]CRISPR/Cas系統(tǒng)與志賀菌耐藥的關(guān)系[D]. 王琳琳.鄭州大學(xué) 2015
[2]糞腸球菌可移動(dòng)元件介導(dǎo)的耐藥性與CRISPR的關(guān)系探索[D]. 蔣偉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012



本文編號(hào)：3009442