為了解藏族人群中流行的乙型肝炎病毒（HBV）基因型及基因重組狀況,收集藏族人群HBsAg陽性樣本,提取HBV DNA并用巢氏PCR的方法擴(kuò)增HBV全長序列,測序后用DNAstar軟件拼接全基因序列,進(jìn)一步利用MEGA6和Simplot軟件進(jìn)行序列同源性和系統(tǒng)進(jìn)化分析。應(yīng)用該方法獲得12株藏族人群HBV全基因序列,分析結(jié)果顯示12株樣本為C/D重組型,其中9株樣本的重組位點(diǎn)位于nt750,3株樣本的重組位點(diǎn)位于nt 1526,以此可分為兩種重組方式,分別命名為C/Da和C/Db;從總體序列同源性來分析12株樣本均屬于C基因型,且與現(xiàn)有的C1-C15亞型的核苷酸差異均大于4%,與C1亞型最為接近。從地理分布來看,C/Da來自西藏中部和北部的拉薩市、阿里和林芝地區(qū),C/Db均來自西藏南部的山南地區(qū),提示兩種重組型C/Da和C/Db在西藏地區(qū)的地理分布具有一定規(guī)律。研究結(jié)果可為西藏地區(qū)特殊HBV基因重組、基因特征分析、病毒進(jìn)化研究以及當(dāng)?shù)匾腋畏揽靥峁﹨⒖肌?nbsp;

【文章來源】：病毒學(xué)報. 2016,32(02)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
材料與方法
    1樣本來源
    2核酸提取
    3 PCR擴(kuò)增HBV全基因組
    4 序列分析
結(jié)果
    1 概況
    2 核苷酸序列同源性和系統(tǒng)發(fā)育分析
    3 基因重組分析
    4 不同亞型的核苷酸差異分析
討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中國人群乙型肝炎病毒基因型間重組的鑒定[J]. 潘登,周彬,楊潔,侯金林.  南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2014(10)
[2]Molecular identification of hepatitis B virus genotypes/subgenotypes:Revised classification hurdles and updated resolutions[J]. Mahmoud Reza Pourkarim,Samad Amini-Bavil-Olyaee,Fuat Kurbanov,Marc Van Ranst,Frank Tacke.  World Journal of Gastroenterology. 2014(23)
[3]一株重組乙型肝炎病毒的全基因克隆和序列分析[J]. 邊濤,沈立萍,王峰,王岳,張麗文,張勇,畢勝利.  病毒學(xué)報. 2008(04)
[4]HBV基因型研究進(jìn)展[J]. 劉旭錦,王凱,范玉琛.  中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2007(04)
[5]我國藏族居民乙型肝炎病毒基因型的初步研究[J]. 徐煙青,周永東,畢勝利.  中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2005(02)
[6]漢藏傣瑤維蒙黎族人群乙型肝炎病毒感染調(diào)查[J]. 駱抗先,何超,何海棠,蘇振家,唐榮西,鄭世可,曾家植,謝志勤,郝新保,盧橋生,梁熾森.  中華流行病學(xué)雜志. 1993 (05)



本文編號：3000781