本文選題：碳青霉烯非敏感 + 大腸埃希菌　； 參考：《重慶醫(yī)科大學(xué)》2015年碩士論文

【摘要】：目的：了解我院2012年碳青霉烯非敏感大腸埃希菌(Carbapenem non-susceptible Escherichia coli, CNS E. coli)的耐藥情況,對(duì)碳青霉烯.非敏感大腸埃希菌的耐藥機(jī)制作初步研究,并進(jìn)行分子流行病學(xué)調(diào)查。方法：收集我院2012年1月至2012年12月分離的碳青霉烯非敏感大腸埃希菌分離株,通過(guò)檢驗(yàn)科LIS系統(tǒng)(Laboratory Information System, LIS)查詢(xún)菌株信息,微量肉湯稀釋法檢測(cè)其對(duì)各類(lèi)抗生素的MIC值；通過(guò)PCR (Polymerase chain reaction)技術(shù)檢測(cè)菌株中的碳青霉烯酶基因blaSME、blaKPC、blaIMP、blaVIM、blaNDM-1、blaOXA-48, ESBLs基因blaCTX-M、blaTEM、blaSHV,氟喹諾酮類(lèi)耐藥決定因子(Fluoroquinolones resistance determinants, QRDs)基因qnrA、qnrB、 qnrC、qnrD、qnrS、aac(6')-Ib-cr,氨基糖苷類(lèi)耐藥決定因子(Aminoglycosides resistance determinants, ARDs)基因armA、rmtB、 aac(6')-Ib,整合子基因Intl1,以及外膜蛋白(Outer membrane proteins, OMPs)基因ompC、ompF,并將檢出的耐藥相關(guān)基因進(jìn)行測(cè)序；脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulse field gel electrophoresis, PFGE)進(jìn)行分子流行病學(xué)的調(diào)查。結(jié)果：1.2012年1月至2012年12月,我院共檢出大腸埃希菌1585株,其中非重復(fù)的碳青霉烯非敏感大腸埃希菌30株,占1.89%。CNSE.coli主要分離自尿液標(biāo)本(13株,43.3%),病區(qū)來(lái)源主要為外科病房和重癥監(jiān)護(hù)室,依次為肝膽外科(6株,20.0%)、泌尿外科(5株,16.7%)、重癥監(jiān)護(hù)室(5株,16.7%)和胃腸外科(3株,10.0%)；病人大多數(shù)為老年人,年齡"g65周歲的為14人(46.7%),男性多于女性。2.藥敏試驗(yàn)結(jié)果顯示：CNS E.colif菌株中有30株(100.0%)對(duì)厄他培南(Ertapenem,ETP)表現(xiàn)為非敏感,11株(36.7%)對(duì)亞胺培南(Imipenem,IPM)非敏感,1株(3.3%)對(duì)美羅培南(Meropenem,MEM)非敏感。100.0%(30/30)的CNS E.coli對(duì)至少一種頭孢菌素類(lèi)抗生素耐藥。氟喹諾酮類(lèi)抗生素和氨基糖苷類(lèi)抗生素的耐藥率分別為96.7%(29/30)和63.3%(19/30)。3.耐藥相關(guān)基因檢測(cè)結(jié)果顯示：有2株(6.7%)CNS E.coli攜帶碳青霉烯酶基因,且均為blaKPC_2；29株(96.7%)檢出的ESBLs基因：blaCTX-M(26/30,86.7%)、blaTEM(12/30,40.0%);20株(66.7%)檢出QRDs基因:qnrA(5/30,16.7%)、qnrB(7/30,23.3％)、aac(6'),-Ib-cr(13/30,43.3%)；11株(36.7%)檢出ARDs基因：,armA(1/30,3.3%). rmtB(2/30,6.7%)、aac(6')-Ib(11/30,36.7%),8株(26.7%)存在OMPs基因缺失：1株(3.3%)僅存在ompC基因缺失,5株(16.7%)僅存在ompF基因缺失,2株(6.7%)存在ompC、ompF基因同時(shí)缺失；整合子基因Intll的檢出率為40.0%(12/30)。4.在2株碳青霉烯酶基因陽(yáng)性的菌株中,ESBLs基因、QRDs基因、ARDs基因和Intll基因的聯(lián)合表達(dá)率分別為100.0%、50.0%、50.0%和50.0%,膜孔蛋白基因缺失率為0.0%；29株ESBLs基因陽(yáng)性的菌株中,QRDs基因、ARDs基因和Intll基因的聯(lián)合表達(dá)率分別為65.5%、37.9%和37.9%,膜孔蛋白基因缺失率為24.1%。我們首次報(bào)道了聯(lián)合表達(dá)blaKPC-2、blaCTX-M-14,'、blaCTX-M-55'、blaTEM、aac(6')-Ib-cr、qnrB、aac(6')-Ib和rmtB的多重耐藥大腸埃希菌分離株(已發(fā)表于Infection, Genetics and Evolution 雜志)。5. PFGE結(jié)果顯示：30株CNS Ecoli分屬于27個(gè)型別,提示我院CNS Ecoli菌株呈現(xiàn)克隆多樣性,且這些菌株的流行并不是由克隆傳播導(dǎo)致的。結(jié)論：1. CNS E.coli菌株主要分離自尿液標(biāo)本,病區(qū)分布以外科病房和重癥監(jiān)護(hù)室為主；我院CNS E.coli菌株主要對(duì)厄他培南非敏感,亞胺培南非敏感次之,美羅培南非敏感最少,且大部分菌株表現(xiàn)為多重耐藥。2.碳青霉烯酶基因并不是導(dǎo)致我院大腸埃希菌對(duì)碳青霉烯類(lèi)抗生素非敏感的主要原因,ESBLs基因聯(lián)合膜孔蛋白缺失可能是我院CNSE.coli產(chǎn)生的主要機(jī)制；多種耐藥基因的聯(lián)合表達(dá)可能會(huì)導(dǎo)致多重耐藥。3.我院的CNS E.coli菌株呈現(xiàn)克隆多樣性,其流行并不是由克隆傳播導(dǎo)致的。
[Abstract]:Objective: to understand the drug resistance of Carbapenem non-susceptible Escherichia coli (CNS E. coli) in our hospital in 2012, and to make a preliminary study on the drug resistant machine of carbapenems and non sensitive Escherichia coli and to investigate the molecular epidemiology. Methods: the isolation of our hospital from January 2012 to December 2012 was collected. Non sensitive Escherichia coli isolates of carbapenems were querying by LIS system (Laboratory Information System, LIS), and microdilution method was used to detect the MIC values of various antibiotics. PCR (Polymerase chain reaction) technique was used to detect carbapenem genes in the strains. DM-1, blaOXA-48, ESBLs gene blaCTX-M, blaTEM, blaSHV, and fluoroquinolone resistance determinants (Fluoroquinolones resistance determinants, QRDs) gene qnrA. Intl1, and the Outer membrane proteins (OMPs) gene ompC, ompF, and the detection of resistance related genes were sequenced, and the molecular epidemiology investigation was carried out by pulse field gel electrophoresis (Pulse field gel electrophoresis, PFGE). Results: from January to December 2012 1.2012, 1585 strains of Escherichia coli were detected in our hospital. 30 non - repetitive carbapenem non sensitive Escherichia coli, which accounted for 1.89%.CNSE.coli mainly from urine specimens (13 strains, 43.3%), were mainly from the surgical ward and intensive care unit, followed by Department of hepatobiliary surgery (6, 20%), Department of Urology (5, 16.7%), severe guardianship (5, 16.7%) and gastrointestinal surgery (3, 10%); the majority of the patients were The elderly, 14 years old G65 (46.7%), and male more than women.2. susceptibility test, 30 strains of CNS E.colif (100%) were non sensitive to eopenem (Ertapenem, ETP), 11 (36.7%) insensitive to imipenem (Imipenem, IPM), 1 (3.3%) against Mei Lopez Nan (Meropenem, MEM) non sensitive.100.0% (30/30) E.coli was resistant to at least one cephalosporin antibiotic. The resistance rates of fluoroquinolones and aminoglycoside antibiotics were 96.7% (29/30) and 63.3% (19/30).3. resistance related genes, respectively: 2 (6.7%) CNS E.coli carried carbapenenase gene, and all were blaKPC_2; 29 (96.7%) found ESBLs gene: BlaCTX-M (26/30,86.7%), blaTEM (12/30,40.0%); 20 strains (66.7%) detected the QRDs gene: qnrA (5/30,16.7%), qnrB (7/30,23.3%), AAC (6'), -Ib-cr (36.7%), 8 strains (26.7%), 1 (3.3%) had only gene deletion, 5 There were only ompF gene deletion (16.7%), 2 (6.7%) ompC and ompF gene deletion, and the detection rate of integron Intll was 40% (12/30).4. in 2 strains of carbapenems gene positive, and the joint expression rates of ESBLs, QRDs, ARDs and Intll genes were 100%, 50%, 50% and 50%, respectively, and the membrane pore protein gene, respectively. The loss rate was 0%, and the joint expression rates of QRDs, ARDs and Intll genes were 65.5%, 37.9% and 37.9% in 29 ESBLs positive strains, and the loss rate of the membrane pore protein gene was 24.1%.. We first reported the joint expression of blaKPC-2, blaCTX-M-14, blaCTX-M-55', blaTEM, AAC (6') -Ib-cr. The Escherichia coli isolates (published in Infection, Genetics and Evolution magazine).5. PFGE results showed that 30 strains of CNS Ecoli belong to 27 types, suggesting that our hospital CNS Ecoli strains present clonal diversity, and the prevalence of these strains is not caused by cloned transmission. Conclusion: 1. CNS E.coli strains are mainly isolated from urine specimens, The area of the disease area was mainly in the surgical ward and the intensive care unit. The CNS E.coli strain in our hospital was not sensitive to eopenem, imipenem was not sensitive, and meropenem was the least sensitive, and the multidrug-resistant.2. carbapenem gene was not caused by Escherichia coli insensitive to carbapenems in our hospital. The main reason for this is that the loss of ESBLs gene combined with membrane pore protein may be the main mechanism of CNSE.coli in our hospital; the joint expression of multiple resistance genes may lead to multiple drug resistance.3. in our hospital, the CNS E.coli strain is cloned diversity, and its prevalence is not caused by the spread of cloning.
【學(xué)位授予單位】：重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：R446.5

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6 吳，

本文編號(hào)：1938187