本文選題：S + rRNA　； 參考：《中國感染控制雜志》2016年04期

【摘要】：目的探討16S rRNA基因擴增與測序在臨床不常見病原菌鑒定中的價值,指導(dǎo)臨床相關(guān)感染的診治。方法選擇臨床微生物實驗室常規(guī)方法難以準確鑒定、無法鑒定或有特殊表型的細菌12株,采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增其16S rRNA基因,測序后進行BLAST比對鑒定菌種,并分析相關(guān)感染的臨床特點。結(jié)果 12株菌經(jīng)PCR擴增均得到陽性條帶(約1 500 bp),均鑒定到種(相似度≥99%),分別為產(chǎn)單核細胞李斯特菌、馬耳他布魯桿菌各2株,死亡梭桿菌、空間羅氏菌、鼻疽奴卡菌、解糖葡萄球菌、放射性根瘤菌、二路普雷沃菌、解甘露醇羅爾斯頓菌及陰道阿托波菌各1株。16S rRNA基因擴增靈敏度高,大腸埃希菌ATCC25922的最低檢測限為1.5×101 CFU/mL。12例患者臨床資料顯示上述菌可引起臨床多部位、多類型感染,選用針對性抗菌藥物治療后11例好轉(zhuǎn),1例死亡。結(jié)論 16S rRNA基因測序方法可快速、準確鑒定少見菌、厭氧菌及難培養(yǎng)細菌,為臨床不同類型感染的病原學(xué)診斷和治療提供實驗室依據(jù)。
[Abstract]:Objective to investigate the value of 16s rRNA gene amplification and sequencing in the identification of uncommon clinical pathogens and to guide the diagnosis and treatment of clinically related infections. Methods the 16s rRNA gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR) from 12 strains of bacteria which could not be identified or had special phenotype by routine methods in clinical microbiology laboratory. The 16s rRNA gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR), and the strains were identified by BLAST comparison after sequencing. The clinical features of related infections were analyzed. Results all the 12 strains were amplified by PCR and positive bands were obtained (about 1 500 BP). All the strains were identified as Listeria monocytogenes, 2 strains of Brucella Malta, 2 strains of Clostridium monocytogenes, 2 strains of Space Roche, and 2 strains of Nucca mallei, respectively. The amplification sensitivity of Staphylococcus glycomyst, Rhizobium radiorrhizobium, Prevow, Rolston and Atobobacter vaginalis were high, and the amplification sensitivity was higher than that of Atobobacter vaginalis. The minimum detection limit of Escherichia coli ATCC25922 was 1.5 脳 101 CFU/mL.12. The clinical data showed that the bacteria could cause multi-site and multi-type infection. Conclusion the 16s rRNA gene sequencing method can quickly and accurately identify rare bacteria, anaerobic bacteria and refractory bacteria, and provide laboratory basis for etiological diagnosis and treatment of different types of infection.
【作者單位】： 首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院;江西衛(wèi)生職業(yè)學(xué)院;
【基金】：首都臨床特色應(yīng)用研究重點專項課題(Z141107002514012)
【分類號】：R440

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