本文選題：基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜　切入點(diǎn)：大腸埃希菌　出處：《中國感染與化療雜志》2016年04期

【摘要】：目的采用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)快速檢測產(chǎn)KPC大腸埃希菌ST131、ST405,并對該方法的可行性進(jìn)行評價。方法收集浙江省人民醫(yī)院臨床分離46株大腸埃希菌,擴(kuò)增blaKPC耐藥基因,采用多位點(diǎn)序列分型方法(MLST)進(jìn)行分型。MALDI-TOF MS對大腸埃希菌進(jìn)行鑒定并對不同克隆的峰圖進(jìn)行主成分分析和算法統(tǒng)計(jì),獲得分型區(qū)分的特征峰。結(jié)果 46株KPC型大腸埃希菌均攜帶KPC-2耐藥基因,MLST方法檢測到2種ST型,分別為ST131和ST405。主成分分析圖顯示ST131和ST405可分為2簇,其中2株ST131和3株ST405分類錯誤。ClinProTools軟件4種算法結(jié)果基本相似,方法特異度和靈敏度分別為93.27%和97.92%。用于區(qū)分ST131和ST405的特征峰主要為8 331.84、4 166.44、4 860.21和2 783.66 Da。這4個峰區(qū)分具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,有較高準(zhǔn)確性。結(jié)論采用MALDI-TOF MS可快速區(qū)分產(chǎn)KPC大腸埃希菌ST131和ST405,具有操作簡單、耗時短、區(qū)分靈敏度和特異度高以及成本低等優(yōu)點(diǎn),能用于大腸埃希菌克隆分型研究。
[Abstract]:Objective to detect KPC producing Escherichia coli ST131 and ST405 by matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF), and to evaluate the feasibility of this method.Methods 46 clinical isolates of Escherichia coli were collected from Zhejiang Provincial people's Hospital and blaKPC resistance genes were amplified.Multilocus sequence typing method was used to identify Escherichia coli by MALDI-TOF MS. Principal component analysis (PCA) and algorithm statistics were performed on different cloned peaks to obtain characteristic peaks.Results 46 strains of KPC Escherichia coli were detected by MLST with KPC-2 resistance gene. The results were ST131 and ST405, respectively.Principal component analysis (PCA) showed that ST131 and ST405 could be divided into 2 clusters, among which 2 strains of ST131 and 3 strains of ST405 were classified wrong. The results of the four algorithms were similar. The specificity and sensitivity of the methods were 93.27% and 97.92%, respectively.The main characteristic peaks used to distinguish ST131 from ST405 are 8 331.84 4 166.44 Li 4 860.21 and 2 783.66 Da.These four peaks are statistically significant and have high accuracy.Conclusion MALDI-TOF MS can be used to distinguish KPC producing Escherichia coli ST131 and ST405 rapidly. It has the advantages of simple operation, short time consuming, high sensitivity, high specificity and low cost. It can be used for the cloning and typing of Escherichia coli.
【作者單位】： 浙江大學(xué)附屬第二醫(yī)院檢驗(yàn)科;浙江省人民醫(yī)院;
【基金】：浙江省中醫(yī)藥管理局資助項(xiàng)目(2011ZA058) 浙江省科學(xué)技術(shù)廳2014年度省公益性技術(shù)應(yīng)用研究計(jì)劃項(xiàng)目(2014C33191) 浙江省科技廳公共衛(wèi)生監(jiān)測與突發(fā)事件處置關(guān)鍵技術(shù)研究科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(2011R50021)
【分類號】：R440

【參考文獻(xiàn)】

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7 吳

本文編號：1702300