本文關(guān)鍵詞： 大氣污染物 復(fù)合暴露 microRNA 神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育 生物信息學(xué)　出處：《環(huán)境化學(xué)》2016年12期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：隨著miRNAs在循環(huán)系統(tǒng)中被檢測出來,血漿miRNAs可以作為臨床疾病早期診斷的生物標記物.為了探究交通和煤炭工業(yè)源大氣污染可能對中樞神經(jīng)系統(tǒng)產(chǎn)生的不良影響,本研究通過建立小鼠SO_2、NO_2及PM_(2.5)復(fù)合染毒模型,利用miRNAs芯片技術(shù)發(fā)現(xiàn)復(fù)合暴露后小鼠血漿中發(fā)生明顯變化的miRNAs,并通過實時熒光定量PCR(qRT-PCR)方法驗證芯片結(jié)果,使用miRanda、miRDB、miRWalk及Targetscan軟件對發(fā)生明顯改變的miRNAs進行靶基因預(yù)測,分析靶基因富集的基因功能(Gene ontology,GO)和信號通路(Pathway).結(jié)果提示,SO_2、NO_2及PM_(2.5)復(fù)合染毒可誘導(dǎo)小鼠血漿miRNA表達譜發(fā)生明顯改變,低濃度暴露組與對照組相比共有19個miRNAs上調(diào),7個miRNAs下調(diào),高濃度組有64個上調(diào),8個下調(diào)(變化倍數(shù)大于2),選擇在兩個濃度處理組中變化倍數(shù)均為最大的miR-144-3p及miR-122-5p用于生物信息學(xué)分析.qRT-PCR結(jié)果表明,miR-144-3p及miR-122-5p變化趨勢與芯片一致.生物信息學(xué)分析顯示差異表達miRNAs所調(diào)控的靶基因明顯富集于30個GO(包括中樞神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育、樹突棘和神經(jīng)棘等)和2條信號通路(軸突導(dǎo)向和癌癥通路),揭示了差異表達miRNAs可能通過調(diào)控靶基因參與復(fù)合暴露介導(dǎo)的中樞神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育.
[Abstract]:As miRNAs is detected in the circulatory system, plasma miRNAs can be used as a biomarker for early diagnosis of clinical diseases. In this study, we established the mice model of SO2SnNO2 and PMS-2.5), found the miRNAss in the plasma of mice after the compound exposure by miRNAs chip technology, and verified the results by real-time fluorescence quantitative PCRqRT-PCRR. Using miRandaI miRDBN miRWalk and Targetscan software to predict the target gene of miRNAs, and to analyze the gene function of target gene enrichment gene and signal pathway Pathway.The results suggest that the compound exposure of miRandaI miRDBD miRWalk and Targetscan can induce significant changes in the expression profile of miRNA in plasma of mice. Compared with the control group, 19 miRNAs were up-regulated and 7 miRNAs were down-regulated in the low concentration exposure group. In high concentration group, 64 were up-regulated and 8 down-regulated (change times were greater than 2). The results of miR-144-3p and miR-122-5p, which were the most varied in both groups, were used in bioinformatics analysis. QRT-PCR results showed that the variation trend of miR-144-3p and miR-122-5p was the same as that of microarray. Bioinformatics analysis showed that the target genes regulated by differential expression of miRNAs were significantly enriched in 30 goos (including central nervous system development). Dendritic spine and nerve spine) and two signal pathways (axonal orientation and cancer pathway) suggest that differential expression of miRNAs may be involved in the development of the central nervous system mediated by complex exposure by regulating target genes.
【作者單位】： 山西大學(xué)環(huán)境與資源學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(91543203,21377076) 教育部高等學(xué)校博士學(xué)科點專項科研基金(20121401110003,20131401110005)資助~~
【分類號】：R446.1;X51

【相似文獻】

相關(guān)期刊論文 前7條

1 楊少迪;蔣佩;湯建新;;microRNA及其靶基因多態(tài)與腫瘤易感性[J];廣東化工;2013年21期

2 趙德堯;杜權(quán);郭江峰;丁先鋒;;血漿microRNA提取技術(shù)優(yōu)化[J];浙江理工大學(xué)學(xué)報;2010年04期

3 張鑫明;朱勝利;李朝陽;原續(xù)波;崔振鐸;楊賢金;;TiO_2納米管載microRNA涂層的制備及性能研究[J];功能材料;2014年06期

4 馬軍勝;劉薇;王法琦;金一和;;胚胎期和哺乳早期全氟辛烷磺酸鹽(PFOS)暴露對大鼠肝臟脂肪酸代謝影響的microRNA組學(xué)研究[J];生態(tài)毒理學(xué)報;2013年01期

5 成永強;李正平;王愈聰;范永山;;MicroRNA分析方法進展[J];化學(xué)進展;2010年08期

6 李曉利;王愈聰;張學(xué)晶;趙云頡;劉成輝;李正平;;雙鏈特異性核酸酶介導(dǎo)的高靈敏度microRNA分析[J];化學(xué)學(xué)報;2014年03期

7 ;[J];;年期

相關(guān)會議論文 前10條

1 荊清;袁文俊;秦永文;;microRNA的基因調(diào)控新功能[A];中國生理學(xué)會第五屆全國心血管、呼吸和腎臟生理學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要匯編[C];2005年

2 靳新;駱志剛;王金華;管乃洋;;microRNA靶標研究進展[A];中國遺傳學(xué)會功能基因組學(xué)研討會論文集[C];2006年

3 ;Comparasion of Inhibitory Effects on Survivin Gene Expression in Prostate Cancer by Vector-based microRNA and siRNA[A];2008年全國生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)術(shù)大會論文摘要[C];2008年

4 朱丹霞;徐衛(wèi);繆扣榮;方成;朱華淵;董華潔;王冬梅;范磊;喬純;李建勇;;慢性淋巴細胞白血病microRNA異常表達研究[A];第13屆全國實驗血液學(xué)會議論文摘要[C];2011年

5 Yangchao Chen;;Small molecule modulators of microRNA-34a with anti-cancer activities[A];2013醫(yī)學(xué)前沿論壇暨第十三屆全國腫瘤藥理與化療學(xué)術(shù)會議論文集[C];2013年

6 金希;厲有名;;單純性脂變與非酒精性脂肪性肝炎間差異microRNA表達譜研究[A];2009香港-北京-杭州內(nèi)科論壇暨2009年浙江省內(nèi)科學(xué)學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2009年

7 賈新正;盧肖男;聶慶華;張細權(quán);;雞部分microRNA的同源預(yù)測與克隆驗證[A];中國動物遺傳育種研究進展——第十五次全國動物遺傳育種學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2009年

8 李炯;段德民;鄭克孝;;新型非標記高通量microRNA芯片技術(shù)[A];第一屆全國生物物理化學(xué)會議暨生物物理化學(xué)發(fā)展戰(zhàn)略研討會論文摘要集[C];2010年

9 徐小濤;陸曉;孫婧;束永前;;肺癌側(cè)群細胞microRNA表達譜檢測及初步分析[A];2010’全國腫瘤分子標志及應(yīng)用學(xué)術(shù)研討會暨第五屆中國中青年腫瘤專家論壇論文匯編[C];2010年

10 王俊峰;李巍;吳小江;阮康成;;大鼠附睪microRNA表達譜的研究[A];第十一次中國生物物理學(xué)術(shù)大會暨第九屆全國會員代表大會摘要集[C];2009年

相關(guān)重要報紙文章 前2條

1 陳英云 喬蕤琳;哈醫(yī)大成功研發(fā)國內(nèi)首例microRNA轉(zhuǎn)基因及敲減小鼠模型[N];黑龍江經(jīng)濟報;2010年

2 記者 陳青;2厘米以下肝癌檢出率88%[N];文匯報;2011年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 崔洪亮;microRNA的腫瘤表達研究及協(xié)同調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析[D];中南大學(xué);2014年

2 馬建華;高粱低磷低氮形態(tài)生理特征及低氮響應(yīng)的microRNA研究[D];山西農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

3 李虔楨;microRNA相關(guān)基因遺傳多態(tài)性與冠心病臨床關(guān)聯(lián)及預(yù)后研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2015年

4 王耀輝;血清microRNA作為乳腺癌診斷標志物的研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

5 周霽子;環(huán)境因素對心臟畸形胎兒影響的表觀遣傳學(xué)機制[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

6 張麗;microRNA通過調(diào)控小膠質(zhì)細胞炎性反應(yīng)參與血管性認知障礙發(fā)生發(fā)展[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

7 查若鵬;肝癌轉(zhuǎn)移相關(guān)microRNA的鑒定及其分子機制研究[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

8 方硯田;結(jié)腸癌干細胞分選、差異microRNA表達譜檢測以及miR-449b-CCND1、E2F3通路在結(jié)腸癌干細胞自我更新的機制研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

9 辛成齊;椰棗microRNA鑒定及其在果實發(fā)育過程中的表達譜研究[D];中國科學(xué)院北京基因組研究所;2015年

10 李棟;先天性心臟病血漿microRNA表達譜及與GATA4靶序列單核苷酸多態(tài)性的關(guān)聯(lián)研究[D];山東大學(xué);2015年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 高智紅;應(yīng)用多樣性增量方法識別人類基因組microRNA前體序列[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2010年

2 王娜娜;microRNA進化關(guān)系及編碼特性研究[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2007年

3 王玫;小麥microRNA的鑒定與分析[D];南昌大學(xué);2007年

4 秦保東;原發(fā)性膽汁性肝硬化microRNA表達譜的檢測及其功能研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2013年

5 吳曉妍;基于納米復(fù)合材料及生物放大技術(shù)構(gòu)建的電化學(xué)microRNA傳感器的研究[D];西南大學(xué);2015年

6 周景輝;2型糖尿病microRNA表達譜及其信號通路研究[D];華南理工大學(xué);2015年

7 姜溪;血漿microRNA-486、microRNA-499在肺癌中的表達及臨床價值的研究[D];河北大學(xué);2015年

8 林杉;營養(yǎng)誘導(dǎo)舍飼綿羊非繁殖季節(jié)發(fā)情相關(guān)microRNA篩選及其靶基因功能驗證[D];石河子大學(xué);2015年

9 林妹妹;microRNA-192 和 microRNA-21 在 IBD 患者中的表達情況[D];福建醫(yī)科大學(xué);2015年

10 徐嬌陽;循環(huán)microRNA用于低氧性肺動脈高壓早期診斷的實驗研究[D];石河子大學(xué);2015年

，

本文編號：1517569