本文關(guān)鍵詞： HLA分型 NGS測序技術(shù) PCR-SBT 高分辨率 中華骨髓庫　出處：《中國輸血雜志》2016年09期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的利用Illumina Miseq二代測序(NGS)技術(shù)進(jìn)行HLA分型工作并分析其結(jié)果的準(zhǔn)確性。方法利用Illumina Miseq二代測序技術(shù),對8 000人份血液標(biāo)本進(jìn)行HLA-A,HLA-B和HLA-DRB1位點(diǎn)的分型工作。為驗(yàn)證二代測序技術(shù)的準(zhǔn)確性,同時選取1 000人份血液標(biāo)本進(jìn)行一代測序(PCR-SBT)分型實(shí)驗(yàn),比較兩種測序方法所得分型結(jié)果。結(jié)果分型結(jié)果顯示PCR-NGS HLA分型技術(shù)獲得的數(shù)據(jù)與一代測序PCR-SBT技術(shù)數(shù)據(jù)完全吻合,且利用NGS測序技術(shù)的8 000人份標(biāo)本中高分辨率結(jié)果 7 908份(含G族1 058人份),中分辨率結(jié)果 92份,高分辨率比例達(dá)到98.85%。結(jié)論利用NGS測序技術(shù)進(jìn)行HLA分型可以大大減少實(shí)驗(yàn)工作量,提高高分辨率結(jié)果比例,更容易對罕見型和新等位基因進(jìn)行鑒定,在工作量大,時間緊迫時相對于傳統(tǒng)的一代測序分型有明顯優(yōu)勢。
[Abstract]:Objective to use Illumina Miseq second-generation sequencing technique to carry out HLA typing and analyze the accuracy of the results. Methods Illumina Miseq second-generation sequencing technique was used. In order to verify the accuracy of the second generation sequencing technique, 1 000 blood samples were selected to carry out a generation sequencing PCR-SBT typing experiment, which was used to type the HLA-AG HLA-B and HLA-DRB1 loci in 8 000 blood samples, in order to verify the accuracy of the second generation sequencing technique, 1 000 blood samples were selected for a generation sequencing PCR-SBT typing experiment. The results showed that the data obtained by the PCR-NGS HLA typing method were in good agreement with the data obtained by the first generation sequencing PCR-SBT technique. Among the 8 000 samples by NGS sequencing technique, 7 908 samples were obtained with high resolution (including 1 058 samples of G group, 92 with medium resolution results). Conclusion using NGS sequencing technique for HLA typing can greatly reduce the workload of experiments, increase the proportion of high resolution results, and make it easier to identify rare and new alleles. When time is short, it has obvious advantage over traditional generation sequencing typing.
【作者單位】： 河北省血液中心;北京諾詩康瀛醫(yī)學(xué)科技有限公司;
【分類號】：R440

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本文編號：1497208