貴陽(yáng)地區(qū)2013年手足口病非EV71、非CVA16型腸道病毒的檢測(cè)分析
本文關(guān)鍵詞: 手足口病 腸道病毒 基因型 出處:《重慶醫(yī)學(xué)》2016年17期 論文類(lèi)型:期刊論文
【摘要】:目的了解貴陽(yáng)地區(qū)引起手足口病(HFMD)的非腸道病毒71型(EV71)、非柯薩奇病毒A(CVA)16型腸道病毒的病原構(gòu)成及優(yōu)勢(shì)型別,為貴陽(yáng)地區(qū)HFMD防治工作提供依據(jù)。方法收集2013年4~6月檢測(cè)為非EV71、非CVA16型腸道病毒的HFMD患者肛拭子標(biāo)本共107例。提取病毒核酸,用巢式RT-PCR法擴(kuò)增病毒VP4區(qū)序列,對(duì)PCR陽(yáng)性擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)與GenBank收錄的序列BLAST比對(duì)確定病毒型別;并對(duì)優(yōu)勢(shì)型別進(jìn)行序列和進(jìn)化分析。結(jié)果 107例標(biāo)本中共有100例標(biāo)本巢式RT-PCR檢測(cè)為陽(yáng)性(93%),其中100例PCR產(chǎn)物測(cè)序成功,經(jīng)BLAST比對(duì)后,100例標(biāo)本病毒型別均得到確定:CVA6為46例,CVA10為30例,CVA5為10例,CVA2為6例,CVA3和CVA4各2例,CVB2和ECHO16各2例。CVA6在型別確定的非EV71、非CVA16型腸道病毒中占42.99%,為優(yōu)勢(shì)腸道病毒型別。結(jié)論貴陽(yáng)地區(qū)引起HFMD的腸道病毒型別多樣,CVA6為非EV71、非CVA16型腸道病毒中的優(yōu)勢(shì)型別。
[Abstract]:Objective to investigate the pathogenic composition and dominant types of non-enterovirus 71 (EV71A) and non-coxsackie virus (NCoV) ACCA16 enterovirus causing HFMD in Guiyang area. To provide the basis for the prevention and treatment of HFMD in Guiyang area. A total of 107 anal swabs from patients with non CVA16 enterovirus (HFMD) were collected. The nucleic acid was extracted and the nucleotide sequence of the VP4 region was amplified by nested RT-PCR. The PCR positive amplification products were sequenced, and the virus type was determined by comparing with the sequence BLAST included in GenBank. The sequence and evolution of the dominant type were analyzed. Results 100 cases of nested RT-PCR were detected positive by nested RT-PCR, among which 100 cases of PCR products were sequenced successfully. After BLAST comparison, the virus types of 100 specimens were confirmed to be 46 cases, 30 cases of CVA10, 10 cases of CVA5, 6 cases of CVA2, 6 cases of CVA2, 6 cases of CVA5, 30 cases of CVA10, 10 cases of CVA5 and 6 cases of CVA2. There were 2 cases of CVB2 and 2 cases of ECHO16 in CVA3 and 2 cases in CVA4, respectively. CVA6 accounted for 42.99% of non-EV71, non-#en3# enterovirus. Conclusion the enterovirus type caused by HFMD in Guiyang area is non-EV71, and it is the dominant type of non-EV71enterovirus.
【作者單位】: 貴州省貴陽(yáng)市第五人民醫(yī)院檢驗(yàn)科;貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院檢驗(yàn)系;
【基金】:貴陽(yáng)市科技局項(xiàng)目(筑科合[2013103]9號(hào)) 貴陽(yáng)市高層次創(chuàng)新型青年衛(wèi)生人才項(xiàng)目(筑衛(wèi)合[2013]創(chuàng)2號(hào))
【分類(lèi)號(hào)】:R512.5;R440
【正文快照】: 手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)主要由腸道病毒(enteroviruses,EV)引起的出疹發(fā)熱急性傳染病,引起HFMD的病毒屬于小RNA病毒科EV屬,引發(fā)HFMD的有20多個(gè)血清型,包括柯薩奇病毒A組(CVAsckievirus A,CVA)的2、4、5、7、9、10、16型等,B組(CVAsckievirus B,CVB)的1、2
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【共引文獻(xiàn)】
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