多位點(diǎn)序列分型技術(shù)在深圳副溶血弧菌同源性分析中的應(yīng)用研究
本文關(guān)鍵詞:多位點(diǎn)序列分型技術(shù)在深圳副溶血弧菌同源性分析中的應(yīng)用研究 出處:《現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué)》2016年19期 論文類型:期刊論文
更多相關(guān)文章: 副溶血弧菌 tdh、trh毒力基因 同源性分析 基因分型 多位點(diǎn)序列分型 MLST
【摘要】:目的了解副溶血弧菌臨床分離株的毒力基因、血清型及基因分型特征,探討多位點(diǎn)序列分型(MLST)分型技術(shù)對其同源性分析的應(yīng)用價值。方法收集深圳地區(qū)2007-2014年食物中毒及醫(yī)院散發(fā)病例來源的68株副溶血弧菌菌株,對其進(jìn)行血清型、毒力基因分析。選擇副溶血弧菌MLST數(shù)據(jù)庫提供的7個管家基因,PCR擴(kuò)增測序后采用Bio Edit、e BURST等軟件,對本次研究的68株副溶血弧菌進(jìn)行MLST同源性分析。結(jié)果 68株副溶血弧菌共得到7種不同的血清型,優(yōu)勢血清型為O3∶K6(47/68),其余血清型分別為O4∶K8、O5∶K68、O4∶K13等。副溶血弧菌臨床分離株94%為tdh+trh-。MIST分型將68株副溶血弧菌分為5個序列型(ST型),ST3為優(yōu)勢序列型(55/68),其余4種ST型中的ST189與ST345構(gòu)成一個同源復(fù)合體CC345,且ST189為ST345的單位點(diǎn)變異型。結(jié)論深圳地區(qū)副溶血弧菌所致的腹瀉病暴發(fā)疫情,其流行菌株ST型別多樣化,疾病控制中需警惕非主流ST型別引起暴發(fā)可能。
[Abstract]:Objective to investigate the clinical isolates of Vibrio parahaemolyticus virulence genes, features and types of gene of serotype, multilocus sequence typing (MLST) typing technology on the application value of homology analysis. Methods 2007-2014 in Shenzhen area of food poisoning and hospital sources of sporadic cases of 68 strains of Vibrio parahaemolyticus strains, serum type the virulence gene analysis. 7 housekeeping genes with Vibrio parahaemolyticus MLST database, PCR sequencing by Bio Edit, e BURST, 68 strains of Vibrio parahaemolyticus in this study were MLST homology analysis. Results 68 strains of Vibrio parahaemolyticus were obtained from 7 different serotypes and the dominant serotype was O3: K6 (47/68), the other serotypes were O4, K8, O5, K68, O4, K13. Tdh+trh-.MIST typing of 68 strains of Vibrio parahaemolyticus strains were divided into 5 sequences of 94% isolates of Vibrio parahaemolyticus (ST type), clinical ST3 The advantage of sequence type (55/68), ST189 ST345 and other 4 kinds of ST type form a homologous complex CC345, ST189 and ST345 variant as a unit. An outbreak of diarrhea in Shenzhen area caused by the conclusion of Vibrio parahaemolyticus, the epidemic strains of ST type diversification, need to be wary of non mainstream type of ST may cause the outbreak of disease control.
【作者單位】: 深圳市福田區(qū)疾病預(yù)防控制中心;成都市食品藥品檢驗研究院;
【基金】:深圳市福田區(qū)衛(wèi)生公益性科研項目重點(diǎn)課題《關(guān)于不同來源的副溶血弧菌分子分型數(shù)據(jù)庫的建立及評估》(FTWS2014005)
【分類號】:R440
【正文快照】: 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,簡稱VP)是一種嗜鹽性細(xì)菌,廣泛的存在于海水,生食水產(chǎn)品中,近幾年由該菌引起的食物中毒及散發(fā)病例事件越來越多,已經(jīng)成為廣東省乃至全國感染性腹瀉的首要病原[1-3]。2010-2014年廣東省食源性疾病監(jiān)測流行的副溶血性弧菌基本以血清型O3∶K6
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本文編號:1367994
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