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基于計算的肝癌比較肝炎/肝硬化組織BRCA1,NEK2,GPSM2,MDK新網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析

發(fā)布時間:2021-09-29 17:10
  本論文原創(chuàng)重構(gòu)了非腫瘤肝炎/肝硬化組織(感染HBV或HCV)和肝癌GSE10140-10141庫顯著性差異表達(dá)BRCA1、NEK2、GPSM2、MDK的新分子和知識網(wǎng)絡(luò),分析提出和驗證了新假說,整合基因表達(dá)差異顯著性分析方法SAM、基于線性規(guī)劃和分解過程的基因重構(gòu)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建算法GNRInfer、Kappa統(tǒng)計和模糊啟發(fā)式聚類分析的DAVID、分子注釋系統(tǒng)MAS。相較非腫瘤肝炎/肝硬化組織,肝癌中BRCA1網(wǎng)絡(luò)的不同激活分子的細(xì)胞周期模塊計算結(jié)果顯示為細(xì)胞周期,細(xì)胞凋亡過程負(fù)調(diào)節(jié),凋亡過程中半胱氨酸型內(nèi)肽酶活性負(fù)調(diào)節(jié),細(xì)胞凋亡負(fù)調(diào)節(jié),程序性細(xì)胞死亡負(fù)調(diào)節(jié),參與有絲分裂細(xì)胞周期的泛素蛋白連接酶活性負(fù)調(diào)節(jié)等。因此我們提出肝癌中BRCA1激活負(fù)向調(diào)節(jié)凋亡相關(guān)的細(xì)胞周期,并且它們之間相互驗證。相較非腫瘤肝炎/肝硬化組織,肝癌中NEK2網(wǎng)絡(luò)的不同激活分子的細(xì)胞周期模塊計算結(jié)果顯示為細(xì)胞周期調(diào)節(jié),有絲分裂細(xì)胞周期,RNA聚合酶Ⅱ啟動子轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄因子活性序列特異性DNA結(jié)合,DNA模板轉(zhuǎn)錄正調(diào)節(jié),RNA聚合酶Ⅱ啟動子轉(zhuǎn)錄正調(diào)節(jié),轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,轉(zhuǎn)錄負(fù)調(diào)節(jié),轉(zhuǎn)錄輔因子活性等。因此我們提出肝癌中NEK2激活轉(zhuǎn)... 

【文章來源】:北京郵電大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:77 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于計算的肝癌比較肝炎/肝硬化組織BRCA1,NEK2,GPSM2,MDK新網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析


圖3-1基于GNRInfer構(gòu)建的非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCAl上游分子網(wǎng)絡(luò)

分子網(wǎng)絡(luò),肝炎,肝硬化


RRM2、S100P、SLC17A7、SPINK1、SULT1C2?抑制?BRCA1,如圖?3-2?所示。??(^y?(^\?(?)?(3?S1??圖3-2基于GNRInfer構(gòu)建的肝癌BRCAl上游分子網(wǎng)絡(luò)。箭頭表示激活關(guān)系,圓圈表示抑??制。??非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCA1下游網(wǎng)絡(luò)計算結(jié)果表明:BRCA1激活??ALDH3A1、ELAVL3、PRSS1?并抑制?AMELY、CDC20、DMN、UBE2C,如圖??3-3所示。??/?\?(?CDC20?]??I?,3??0?@?w??圖3-3基于GNRInfei?構(gòu)建的非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCAl下游分子網(wǎng)絡(luò)。箭頭表示激活??關(guān)系,圓圈表示抑制。??15??

分子網(wǎng)絡(luò),肝癌,肝炎,肝硬化


圖3-2基于GNRInfer構(gòu)建的肝癌BRCAl上游分子網(wǎng)絡(luò)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Epidemiology of hepatitis C virus infection[J]. Miriam J Alter.  World Journal of Gastroenterology. 2007(17)



本文編號:3414112

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