基于計算的肝癌比較肝炎/肝硬化組織BRCA1,NEK2,GPSM2,MDK新網絡構建及分析
發(fā)布時間:2021-09-29 17:10
本論文原創(chuàng)重構了非腫瘤肝炎/肝硬化組織(感染HBV或HCV)和肝癌GSE10140-10141庫顯著性差異表達BRCA1、NEK2、GPSM2、MDK的新分子和知識網絡,分析提出和驗證了新假說,整合基因表達差異顯著性分析方法SAM、基于線性規(guī)劃和分解過程的基因重構網絡構建算法GNRInfer、Kappa統(tǒng)計和模糊啟發(fā)式聚類分析的DAVID、分子注釋系統(tǒng)MAS。相較非腫瘤肝炎/肝硬化組織,肝癌中BRCA1網絡的不同激活分子的細胞周期模塊計算結果顯示為細胞周期,細胞凋亡過程負調節(jié),凋亡過程中半胱氨酸型內肽酶活性負調節(jié),細胞凋亡負調節(jié),程序性細胞死亡負調節(jié),參與有絲分裂細胞周期的泛素蛋白連接酶活性負調節(jié)等。因此我們提出肝癌中BRCA1激活負向調節(jié)凋亡相關的細胞周期,并且它們之間相互驗證。相較非腫瘤肝炎/肝硬化組織,肝癌中NEK2網絡的不同激活分子的細胞周期模塊計算結果顯示為細胞周期調節(jié),有絲分裂細胞周期,RNA聚合酶Ⅱ啟動子轉錄,轉錄因子活性序列特異性DNA結合,DNA模板轉錄正調節(jié),RNA聚合酶Ⅱ啟動子轉錄正調節(jié),轉錄因子結合,轉錄負調節(jié),轉錄輔因子活性等。因此我們提出肝癌中NEK2激活轉...
【文章來源】:北京郵電大學北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:77 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1基于GNRInfer構建的非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCAl上游分子網絡
RRM2、S100P、SLC17A7、SPINK1、SULT1C2?抑制?BRCA1,如圖?3-2?所示。??(^y?(^\?(?)?(3?S1??圖3-2基于GNRInfer構建的肝癌BRCAl上游分子網絡。箭頭表示激活關系,圓圈表示抑??制。??非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCA1下游網絡計算結果表明:BRCA1激活??ALDH3A1、ELAVL3、PRSS1?并抑制?AMELY、CDC20、DMN、UBE2C,如圖??3-3所示。??/?\?(?CDC20?]??I?,3??0?@?w??圖3-3基于GNRInfei?構建的非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCAl下游分子網絡。箭頭表示激活??關系,圓圈表示抑制。??15??
圖3-2基于GNRInfer構建的肝癌BRCAl上游分子網絡
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Epidemiology of hepatitis C virus infection[J]. Miriam J Alter. World Journal of Gastroenterology. 2007(17)
本文編號:3414112
【文章來源】:北京郵電大學北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:77 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1基于GNRInfer構建的非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCAl上游分子網絡
RRM2、S100P、SLC17A7、SPINK1、SULT1C2?抑制?BRCA1,如圖?3-2?所示。??(^y?(^\?(?)?(3?S1??圖3-2基于GNRInfer構建的肝癌BRCAl上游分子網絡。箭頭表示激活關系,圓圈表示抑??制。??非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCA1下游網絡計算結果表明:BRCA1激活??ALDH3A1、ELAVL3、PRSS1?并抑制?AMELY、CDC20、DMN、UBE2C,如圖??3-3所示。??/?\?(?CDC20?]??I?,3??0?@?w??圖3-3基于GNRInfei?構建的非腫瘤肝炎/肝硬化組織BRCAl下游分子網絡。箭頭表示激活??關系,圓圈表示抑制。??15??
圖3-2基于GNRInfer構建的肝癌BRCAl上游分子網絡
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Epidemiology of hepatitis C virus infection[J]. Miriam J Alter. World Journal of Gastroenterology. 2007(17)
本文編號:3414112
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