本文關(guān)鍵詞：中國林業(yè)生物安全風(fēng)險(xiǎn)評價(jià)與管理對策研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《復(fù)旦大學(xué)》 2014年

不同水陸生境中喜旱蓮子草表觀遺傳調(diào)控因子動態(tài)表達(dá)式樣分析

鄧瑩  

【摘要】：喜旱蓮子草(Alternanthera philoxeroides (Mart.) Griseb.)是一種入侵植物,種內(nèi)遺傳多樣性很低,主要依靠極強(qiáng)的表型可塑性入侵不同生境。表型可塑性變異與基因選擇性表達(dá)密切相關(guān),而表觀遺傳調(diào)控因子(如：DNA甲基化)參與基因的表達(dá)調(diào)控,介導(dǎo)可塑性變異的發(fā)生。為了解喜旱蓮子草適應(yīng)不同水陸生境過程中表觀遺傳調(diào)控因子的作用,我們對同質(zhì)園中栽培的喜早蓮子草進(jìn)行不同水陸條件處理,并運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR、亞硫酸氫鈉測序、RNA-Seq高通量測序等方法檢測各類表觀遺傳調(diào)控因子在不同環(huán)境條件下動態(tài)表達(dá)的特點(diǎn),為研究喜旱蓮子草表型可塑性變異發(fā)生的分子基礎(chǔ)提供依據(jù)。研究結(jié)果顯示：(1)16個(gè)表觀遺傳調(diào)控相關(guān)基因在不同水陸處理?xiàng)l件下、在不同處理時(shí)間點(diǎn)表達(dá)水平變化顯著,且多在水淹處理早期被強(qiáng)烈誘導(dǎo)上調(diào)。(2)兩個(gè)在不同水陸處理下顯著差異表達(dá)基因的啟動子區(qū)中多個(gè)胞嘧啶位點(diǎn)甲基化修飾式樣隨不同處理?xiàng)l件以及不同處理時(shí)間呈現(xiàn)動態(tài)變化的特點(diǎn),其中涉及一些保守調(diào)控元件和部分連續(xù)分布的非對稱胞嘧啶位點(diǎn)。(3)對不同水陸處理?xiàng)l件下miRNA表達(dá)譜進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)118個(gè)與不同處理?xiàng)l件相關(guān)且在不同處理時(shí)間點(diǎn)差異表達(dá)的miRNA,根據(jù)表達(dá)式樣將這些miRNA分為12類。本研究結(jié)果初步揭示了喜旱蓮子草響應(yīng)不同水陸生境過程中表觀遺傳調(diào)控因子的動態(tài)表達(dá)式樣,證實(shí)了表觀遺傳變異與喜旱蓮子草表型可塑性變異的相關(guān)性,為深入研究喜早蓮子草通過表型可塑性變異廣泛適應(yīng)不同水陸生境的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制提供了基本信息。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：Q943.2
【目錄】：

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本文編號：185827